使用猪用B超机经直肠和经腹途径均可用于母猪卵巢扫描。经腹扫描是通过将探头放置在腹股沟区乳腺上方的下胁部进行的，方法与妊娠诊断类似。卵巢位于后腿的背颅位置；传感器应向上指向脊柱并稍微前后倾斜以显示膀胱，作为定位卵巢的参考；在超声图像中，卵巢将出现在膀胱的头侧。当经直肠进行时，探头是手持式的，并通过直肠手动引导。卵巢位于与直肠相关的腹侧，内部大约30cm~40cm。值得一提的是，经直肠检查需要事先清除粪便，以便有足够的组织/探针界面来获得高质量的成像。
通常首选经直肠方法，因为经腹扫描需要更多练习才能获得良好的图像。然而，根据操作者的经验，在多次检查后使用经腹扫描获得了良好的结果。
使用猪用B超机经腹扫描的主要局限性与周围组织（即结肠），尤其是左腹壁对卵巢的闭塞有关。此外，由于母猪不断移动，通常难以获得卵巢结构的详细图像。另一方面，经直肠扫描可以更好、更详细地扫描卵巢；甚至可以计算母猪卵巢结构。
在这两种技术中，充满液体的卵泡在发情后期和发情后期表现为3mm~11mm的无回声卵巢结构。应注意将滤泡与周围血管、囊肿和出血体区分开来。黄体的回声与卵巢基质的回声相似，只有训练有素的超声检测人员才能在大约50%的母猪中看到。
为了确定排卵时间，需要反复进行超声检查（看下图），并且排卵时间被认为发生在最后一次检测到卵泡并随后消失的两次检查间隔的中间。
